A continuación, se describe una lista de las aplicaciones más útiles para el procesamiento de datos derivados de la investigación, documentos, imágenes y otras relacionadas a la administración del sistema.
Para edición de documentos y libros en diferentes formatos:
LaTeX: Lenguaje que permite preparar automáticamente un documento de apariencia estándar y de alta calidad. LaTeX es un sistema de escritura de alta calidad que incluye características diseñadas para la producción de documentación técnica y científica.
Texmaker: Es un editor LaTex facil de usar y configurar, muy intuitivo y con una gran cantidad de funciones predefinidas, facilitando a los usuarios el uso de LaTex.
LibreOffice: Conjunto de aplicaciones de productividad ofimática. Esta suite de ofimática LibreOffice incluye plugins para la interacción con LaTex.
kbibtex: Editor BibTex para la gestión de bibliografía en LaTex. Buscador incorporado que incluye las principales bases de datos para búsqueda de artículos: Google Scholar, ScienceDirect, IEEEXplore, ACM y otros.
Bibus: Software para la gestión de bases de datos de referencias bibliográficas. Intuitivo, fácil de usar, trabaja con LibreOffice.org, OpenOffice.org (Linux, Windows, MacOS X) y MS Word (Windows).
Sigil: Editor EPUB multiplataforma de código abierto para crear e-books. Soporta ficheros EPUB, html, imágenes y estilos de hojas.
Calibre: Gestor de librerías para e-books y convertidor entre diferentes formatos (EPUB, MOBI, AZW3, PDF y muchos otros).
Kate: Editor de textos avanzado con interfaz multidocumento y división de ventanas. Permite la identificación automática de scripts y otras funciones útiles para la edición de programas.
PDFSam: Herramienta para dividir y fusionar documentos PDF.
Para edición de imágenes y gráficos:
Inkscape: Editor de gráficos vectoriales que cumple completamente los estándares XML, SVG y CSS2. Posee capacidades similares a Ilustrator, CorelDraw o Freehand.
Gimp: Editor de imágenes digitales que puede ser utilizado para el retoque profesional de fotografías, para crear simples dibujos o como convertidor de formatos.
Dia: Editor de diagramas, gráficos, diagramas de flujo, redes, etc.
Planner: Gestor de proyectos, permite generar diagramas Gantt. Herramienta para la gestión de proyectos, incluyendo programación, seguimiento y exportación a diferentes formatos.
Para procesamiento matemático y la simulación:
Scilab: Herramienta matemática de alto nivel para el cálculo científico.
Octave: Herramienta de análisis matemático con comandos similares a Matlab.
NS-2: Simulador de eventos discretos (NS-2) orientado a la investigación de redes. NS-2 presta un importante apoyo para la simulación de TCP, enrutamiento y protocolos de multidifusión a través de redes cableadas e inalámbricas, tanto locales como por satélite.
Para el análisis de tráfico:
Wireshark: Potentes analizadores de tráfico con interfaz gráfica o por medio de línea de comandos.
Tcpdump: Herramienta para captura de tráfico de red en tiempo real gestionada por línea de comandos.
Otras aplicaciones importantes:
Eclipse: Plataforma de Cliente Enriquecido Eclipse, una suite de herramientas de programación de código abierto multiplataforma.
VirtualBox: Entorno de gestión de máquinas virtuales multiplataforma. Excelente para ejecutar múltiples sistemas operativos en un mismo ordenador.
keepassx: Una aplicación que asegura la gestión de datos personales como claves, nombres, comentarios y demás información en una base de datos cifrada con AES o Twofish usando claves de 256 bits.
Backintime: Herramienta simple de backup en Linux.
